اپلیکیشن اندرویدی فلش‌کارت آموزشی مدل‌سازی تکامل: ژنتیک جمعیت از دیدگاه ریاضی

📚 کتاب آموزشی جامع

📚 اطلاعات کتاب

عنوان کتاب: کتاب مدل‌سازی تکامل: ژنتیک جمعیت از دیدگاه ریاضی

موضوع کلی: زیست‌شناسی کمی و مدل‌سازی

موضوع میانی: مبانی ریاضی ژنتیک جمعیت

📋 سرفصل‌های کتاب (100 موضوع)

• 1. مقدمه‌ای بر زیست‌شناسی کمی و مدل‌سازی
• 2. مفاهیم بنیادی ژنتیک جمعیت: ژن، آلل، لوکوس، ژنوتیپ
• 3. قوانین مندل و اساس وراثت
• 4. تعریف فراوانی آلل و ژنوتیپ در یک جمعیت
• 5. مقدمه‌ای بر تعادل هاردی-واینبرگ: اصول و فروض
• 6. استخراج فرمول‌های تعادل هاردی-واینبرگ
• 7. کاربرد تعادل هاردی-واینبرگ برای آلل‌های متعدد
• 8. تعادل هاردی-واینبرگ برای ژن‌های وابسته به جنس
• 9. آزمون‌های آماری برای بررسی انحراف از تعادل هاردی-واینبرگ
• 10. تاریخچه و اهمیت تعادل هاردی-واینبرگ در ژنتیک جمعیت
• 11. معرفی نیروهای تکاملی: جهش، رانش، انتخاب، مهاجرت
• 12. مفهوم جهش: انواع و نرخ آن
• 13. مدل‌های ساده جهش: جهش یک‌طرفه
• 14. مدل‌های جهش برگشت‌پذیر
• 15. اثر جهش بر فراوانی آلل‌ها
• 16. معرفی رانش ژنتیکی: نمونه‌گیری تصادفی گامت‌ها
• 17. مدل فیشر-رایت: اساس ریاضی رانش
• 18. مدل موران: جایگزین مدل فیشر-رایت
• 19. اثر رانش بر کاهش تنوع ژنتیکی
• 20. احتمال تثبیت (Fixation) آلل‌های جدید تحت رانش
• 21. زمان لازم برای تثبیت یا حذف آلل تحت رانش
• 22. اندازه مؤثر جمعیت (Ne): تعریف و اهمیت
• 23. محاسبه اندازه مؤثر جمعیت در سناریوهای مختلف
• 24. رابطه رانش و جهش: تعادل جهش-رانش
• 25. تئوری یکسان‌سازی (Coalescent) - مقدمه
• 26. مدل کینگمن کواُلِسِنت
• 27. زمان تا آخرین جد مشترک (TMRCA)
• 28. نمودارهای تبارزایی (Genealogical Trees) در تئوری کواُلِسِنت
• 29. تئوری کواُلِسِنت با جهش
• 30. کاربرد تئوری کواُلِسِنت در بررسی تاریخچه جمعیت‌ها
• 31. مفهوم برازش (Fitness): برازش مطلق و نسبی
• 32. ضریب انتخاب (Selection Coefficient)
• 33. مدل‌های انتخاب برای آلل‌های هاپلوئید
• 34. دینامیک فراوانی آلل تحت انتخاب جهت‌دار (Directional Selection)
• 35. انتخاب برتری هتروزیگوت (Overdominance): تعادل پایدار
• 36. انتخاب ضعف هتروزیگوت (Underdominance): تعادل ناپایدار
• 37. انتخاب وابسته به فراوانی (Frequency-Dependent Selection)
• 38. انتخاب علیه آلل مغلوب و غالب
• 39. تعادل انتخاب-جهش (Mutation-Selection Balance)
• 40. بار ژنتیکی (Genetic Load) ناشی از جهش و انتخاب
• 41. معرفی مهاجرت (Migration) به عنوان نیروی تکاملی
• 42. مدل جزیره‌ای (Island Model) مهاجرت
• 43. اثر مهاجرت بر همگن‌سازی جمعیت‌ها
• 44. تعادل مهاجرت-رانش
• 45. تعادل مهاجرت-انتخاب
• 46. مفهوم کلین (Cline) و توزیع جغرافیایی آلل‌ها
• 47. مدل سنگفرشی (Stepping Stone Model) مهاجرت
• 48. اندازه‌گیری جریان ژن (Gene Flow)
• 49. شاخص‌های تمایز ژنتیکی: FST
• 50. تعامل نیروهای تکاملی: مروری کلی
• 51. جفت‌گیری غیرتصادفی: مقدمه‌ای بر همخونی (Inbreeding)
• 52. ضریب همخونی (Inbreeding Coefficient, F) و محاسبه آن
• 53. اثر همخونی بر فراوانی ژنوتیپ‌ها
• 54. سرکوب همخونی (Inbreeding Depression): مکانیسم‌ها و عواقب
• 55. مدل‌های ریاضی برای محاسبه F در شجره‌نامه‌ها
• 56. جفت‌گیری جور (Assortative Mating) و ناهمجور (Disassortative Mating)
• 57. اثر جفت‌گیری جور بر ساختار ژنتیکی جمعیت
• 58. مبانی ژنتیک کمی: صفات پیوسته و گسسته
• 59. واریانس فنوتیپی: واریانس ژنتیکی و محیطی
• 60. تفکیک واریانس ژنتیکی: افزایشی، غلبه‌ای، اپیستاتیک
• 61. مفهوم وراثت‌پذیری (Heritability): وراثت‌پذیری به مفهوم وسیع
• 62. وراثت‌پذیری به مفهوم مضیق و اهمیت آن
• 63. برآورد وراثت‌پذیری از طریق رگرسیون والدین-فرزند
• 64. پاسخ به انتخاب (Response to Selection) و معادله بریدر
• 65. مدل‌های ژنتیکی برای صفات آستانه‌ای (Threshold Traits)
• 66. مدل‌های پلی‌ژنیک (Polygenic Models)
• 67. تعیین محل صفات کمی (QTL mapping) - مقدمه
• 68. طراحی آزمایش‌های QTL
• 69. تجزیه و تحلیل آماری داده‌های QTL
• 70. کاربرد ژنتیک کمی در اصلاح نژاد و پزشکی
• 71. ارتباط ژنی (Linkage) و عدم تعادل پیوستگی (Linkage Disequilibrium, LD)
• 72. تعریف عدم تعادل پیوستگی (D و D')
• 73. اندازه‌گیری عدم تعادل پیوستگی: r^2
• 74. مکانیسم‌های ایجاد عدم تعادل پیوستگی
• 75. نرخ نوترکیبی (Recombination Rate) و نقش آن
• 76. کاهش عدم تعادل پیوستگی توسط نوترکیبی
• 77. اثر انتخاب و رانش بر عدم تعادل پیوستگی
• 78. نقش عدم تعادل پیوستگی در مطالعات انجمن‌یابی سراسری ژنوم (GWAS)
• 79. مدل‌های دو لوکوسی (Two-Locus Models)
• 80. اپیستاز (Epistasis): تعامل بین ژن‌ها
• 81. دینامیک فراوانی ژنوتیپ‌های چند لوکوسی تحت انتخاب
• 82. تکامل نرخ نوترکیبی
• 83. بار نوترکیبی (Recombination Load)
• 84. تداخل بین انتخاب در لوکوس‌های مرتبط
• 85. کاربردهای LD در بازسازی تاریخچه جمعیت و نقشه‌برداری ژنی
• 86. تئوری کواُلِسِنت پیشرفته: کواُلِسِنت با انتخاب
• 87. کواُلِسِنت با نوترکیبی
• 88. کواُلِسِنت با تغییر اندازه جمعیت
• 89. مدل‌های کواُلِسِنت برای ساختار جمعیت
• 90. ژنتیک فضایی (Spatial Genetics): مدل‌های متاجمعیت (Metapopulation)
• 91. ژنتیک منظره (Landscape Genetics)
• 92. مقدمه‌ای بر گونه‌زایی (Speciation) از دیدگاه ژنتیک جمعیت
• 93. مدل‌های گونه‌زایی: گونه‌زایی آلوپاتریک، سیمپاتریک، پاراپاتریک
• 94. موانع تولیدمثلی (Reproductive Isolation) و اساس ژنتیکی آن‌ها
• 95. هیبریداسیون و نواحی هیبریدی
• 96. تخمین پارامترهای ژنتیک جمعیت (مانند Ne, m, s)
• 97. روش‌های آماری برای تشخیص انتخاب مثبت (Positive Selection)
• 98. تجزیه و تحلیل داده‌های ژنومی در ژنتیک جمعیت
• 99. مدل‌سازی کامپیوتری و شبیه‌سازی در ژنتیک جمعیت
• 100. چالش‌ها و چشم‌اندازهای آینده در مدل‌سازی تکامل