اپلیکیشن اندرویدی فلش‌کارت آموزشی رمزگشایی حیات: کتاب جامع تحلیل توالی و ژنوم با بیوانفورماتیک

📚 کتاب آموزشی جامع

📚 اطلاعات کتاب

عنوان کتاب: کتاب رمزگشایی حیات: کتاب جامع تحلیل توالی و ژنوم با بیوانفورماتیک

موضوع کلی: بیوانفورماتیک و تحلیل داده‌های زیستی

موضوع میانی: تحلیل توالی و ژنوم

📋 سرفصل‌های کتاب (100 موضوع)

• 1. مبانی بیوانفورماتیک و تحلیل توالی
• 2. آشنایی با پایگاه‌های داده زیستی
• 3. فرمت‌های فایل توالی (FASTA, GenBank, etc.)
• 4. مقدمه‌ای بر همترازی توالی
• 5. ماتریس‌های امتیازدهی همترازی (PAM, BLOSUM)
• 6. همترازی جفتی: الگوریتم نیدلمن-وانچ
• 7. همترازی جفتی: الگوریتم اسمیت-واترمن
• 8. همترازی سراسری در مقابل همترازی محلی
• 9. جستجوی پایگاه داده با BLAST
• 10. انواع BLAST و کاربردهای آن‌ها
• 11. ارزیابی آماری نتایج BLAST (E-value, P-value)
• 12. همترازی چندگانه توالی (MSA)
• 13. الگوریتم‌های پیشرو همترازی چندگانه (ClustalW, MUSCLE)
• 14. آنالیز فیلوژنتیک: مفاهیم پایه
• 15. ساخت درخت فیلوژنتیک: روش‌های فاصله‌ای (UPGMA, Neighbor-Joining)
• 16. ساخت درخت فیلوژنتیک: روش‌های مبتنی بر کاراکتر (Maximum Parsimony, Maximum Likelihood)
• 17. ارزیابی درخت‌های فیلوژنتیک (Bootstrapping)
• 18. مفاهیم ژنومیک ساختاری
• 19. حاشیه‌نویسی ژنوم: پیش‌بینی ژن
• 20. روش‌های پیش‌بینی ژن: مبتنی بر محتوا (Content-based)
• 21. روش‌های پیش‌بینی ژن: مبتنی بر همترازی (Alignment-based)
• 22. پیش‌بینی RNA غیرکدکننده
• 23. آنالیز تکرارهای ژنومی
• 24. مفاهیم ژنومیک عملکردی
• 25. آنالیز بیان ژن: میکروآرایه
• 26. آنالیز بیان ژن: RNA-Seq
• 27. نرمال‌سازی داده‌های بیان ژن
• 28. آنالیز آماری داده‌های بیان ژن (Differential Expression Analysis)
• 29. مجموعه‌یابی ژن (Gene Set Enrichment Analysis - GSEA)
• 30. مفاهیم پروتئومیکس
• 31. شناسایی پروتئین با طیف‌سنجی جرمی (Mass Spectrometry)
• 32. آنالیز کمی پروتئومیکس
• 33. تعیین محل زیرسلولی پروتئین
• 34. مفاهیم متابولومیکس
• 35. شناسایی متابولیت‌ها با طیف‌سنجی جرمی و NMR
• 36. آنالیز مسیر متابولیکی
• 37. مدل‌سازی شبکه‌های متابولیکی
• 38. مفاهیم ژنتیک جمعیت
• 39. تنوع ژنتیکی و آلل‌ها
• 40. قانون هاردی-واینبرگ
• 41. نیروهای موثر بر تغییر فراوانی آللی (جهش، انتخاب طبیعی، رانش ژنتیکی)
• 42. آنالیز پیوستگی (Linkage Analysis)
• 43. مطالعات همبستگی ژنومی گسترده (GWAS)
• 44. مفاهیم ژنومیک مقایسه‌ای
• 45. هم‌خطی (Synteny)
• 46. تکامل ژنوم
• 47. انتقال افقی ژن
• 48. مفاهیم متاژنومیکس
• 49. آنالیز توالی‌های متاژنومیک
• 50. طبقه‌بندی تاکسونومیکی توالی‌های متاژنومیک
• 51. آنالیز عملکردی جوامع میکروبی
• 52. مفاهیم سیستم‌های بیولوژی
• 53. مدل‌سازی شبکه‌های تنظیمی ژن
• 54. مدل‌سازی شبکه‌های سیگنالینگ
• 55. شبیه‌سازی سیستم‌های بیولوژیکی
• 56. بیوانفورماتیک ساختاری
• 57. پیش‌بینی ساختار پروتئین: همولوژی مدلینگ
• 58. پیش‌بینی ساختار پروتئین: ab initio
• 59. اعتبارسنجی ساختار پروتئین
• 60. آنالیز ساختار پروتئین
• 61. برهم‌کنش پروتئین-پروتئین
• 62. برهم‌کنش پروتئین-لیگاند
• 63. طراحی دارو: غربالگری مجازی
• 64. طراحی دارو: مدل‌سازی مولکولی
• 65. یادگیری ماشین در بیوانفورماتیک: رگرسیون
• 66. یادگیری ماشین در بیوانفورماتیک: طبقه‌بندی
• 67. یادگیری ماشین در بیوانفورماتیک: خوشه‌بندی
• 68. شبکه‌های عصبی در بیوانفورماتیک
• 69. یادگیری عمیق در بیوانفورماتیک
• 70. تحلیل داده‌های بزرگ در بیوانفورماتیک (Big Data)
• 71. محاسبات ابری در بیوانفورماتیک
• 72. استانداردهای داده در بیوانفورماتیک
• 73. اخلاق در بیوانفورماتیک
• 74. حریم خصوصی داده‌های ژنتیکی
• 75. کاربردهای بیوانفورماتیک در پزشکی شخصی
• 76. کاربردهای بیوانفورماتیک در کشاورزی
• 77. کاربردهای بیوانفورماتیک در محیط زیست
• 78. تحلیل توالی نسل جدید (NGS)
• 79. پردازش داده‌های خام NGS (Quality Control, Trimming)
• 80. همترازی توالی‌های NGS به ژنوم مرجع
• 81. شناسایی واریانت‌های ژنتیکی (SNP, Indel)
• 82. آنالیز واریانت‌های ژنتیکی
• 83. حاشیه‌نویسی واریانت‌های ژنتیکی
• 84. اثرات واریانت‌های ژنتیکی بر عملکرد ژن
• 85. آنالیز مسیر واریانت‌های ژنتیکی
• 86. فیلتر کردن واریانت‌های ژنتیکی
• 87. بررسی آماری واریانت‌های ژنتیکی
• 88. تفسیر واریانت‌های ژنتیکی
• 89. گزارش‌دهی واریانت‌های ژنتیکی
• 90. اهمیت بالینی واریانت‌های ژنتیکی
• 91. مقدمه‌ای بر ویروس‌شناسی محاسباتی
• 92. تحلیل ژنوم ویروس
• 93. تکامل ویروس
• 94. پیش‌بینی اپی توپ
• 95. طراحی واکسن
• 96. طراحی داروهای ضد ویروسی
• 97. مقدمه‌ای بر ایمونوانفورماتیک
• 98. تحلیل داده‌های ایمنی
• 99. شناسایی نشانگرهای زیستی بیماری
• 100. پیش‌بینی پاسخ به درمان