اپلیکیشن اندرویدی فلش‌کارت آموزشی از توالی تا عملکرد: کاوش در بیوانفورماتیک و ژنومیک کاربردی با رویکرد Pevsner

📚 کتاب آموزشی جامع

📚 اطلاعات کتاب

عنوان کتاب: کتاب از توالی تا عملکرد: کاوش در بیوانفورماتیک و ژنومیک کاربردی با رویکرد Pevsner

موضوع کلی: زیست‌شناسی محاسباتی و تحلیل داده‌های زیستی

موضوع میانی: ژنومیک کاربردی و تحلیل عملکردی ژن‌ها

📋 سرفصل‌های کتاب (100 موضوع)

• 1. مقدمه‌ای بر بیوانفورماتیک و ژنومیک
• 2. مفاهیم پایه‌ای زیست‌شناسی مولکولی
• 3. ساختار و عملکرد DNA و RNA
• 4. مروری بر ژنوم و سازماندهی ژنوم
• 5. تکنیک‌های تعیین توالی DNA: نسل اول و دوم
• 6. تکنیک‌های تعیین توالی DNA: نسل سوم و فراتر
• 7. پایگاه‌های داده‌های زیستی: NCBI، EBI، DDBJ
• 8. فرمت‌های فایل‌های بیولوژیکی: FASTA، GenBank، SAM/BAM
• 9. الگوریتم‌های تراز توالی: تراز جفتی
• 10. الگوریتم‌های تراز توالی: تراز چندگانه
• 11. BLAST: جستجوی شباهت توالی
• 12. Homology Modeling و پیش‌بینی ساختار پروتئین
• 13. مروری بر فیلوژنی مولکولی
• 14. روش‌های ساخت درخت فیلوژنتیک
• 15. تحلیل فیلوژنتیک با استفاده از نرم‌افزارهای بیوانفورماتیکی
• 16. ژنومیک ساختاری: حاشیه‌نویسی ژنوم
• 17. پیش‌بینی ژن‌ها: روش‌های برون‌زا و درون‌زا
• 18. ارزیابی کیفیت حاشیه‌نویسی ژنوم
• 19. ژنومیک مقایسه‌ای: مفاهیم و کاربردها
• 20. روش‌های مقایسه ژنوم‌ها
• 21. شناسایی ژن‌های ارتوگ و پارالوگ
• 22. ژنومیک عملکردی: ترانسکریپتومیکس
• 23. تکنولوژی ریزآرایه (Microarray)
• 24. تکنیک‌های RNA-Seq
• 25. تحلیل داده‌های RNA-Seq: نرمال‌سازی و تعیین بیان افتراقی
• 26. آشنایی با نرم‌افزارهای تحلیل RNA-Seq
• 27. مفاهیم پایه‌ای آماری در تحلیل داده‌های زیستی
• 28. آمار توصیفی و استنباطی
• 29. آزمون‌های آماری برای تحلیل بیان ژن
• 30. ژنومیک عملکردی: پروتئومیکس
• 31. تکنیک‌های طیف‌سنجی جرمی (Mass Spectrometry)
• 32. تحلیل داده‌های پروتئومیکس
• 33. شناسایی و کمی‌سازی پروتئین‌ها
• 34. ژنومیک عملکردی: متابولومیکس
• 35. تکنیک‌های آنالیز متابولیت‌ها
• 36. تحلیل داده‌های متابولومیکس
• 37. مسیرهای متابولیکی و شبکه‌های تنظیمی
• 38. ژنومیک عملکردی: اینتراکشنومیکس
• 39. بررسی برهم‌کنش‌های پروتئین-پروتئین
• 40. روش‌های تجربی و محاسباتی شناسایی برهم‌کنش‌ها
• 41. شبکه‌های تنظیمی ژن
• 42. تحلیل شبکه‌های زیستی
• 43. مفاهیم گراف و نظریه گراف
• 44. روش‌های تحلیل مسیر (Pathway Analysis)
• 45. Ontology Gene (GO) و آنالیز غنی‌سازی
• 46. آنالیز غنی‌سازی مسیر
• 47. بیان ژن وابسته به بافت و سلول
• 48. تحلیل تک‌سلولی (Single-Cell Analysis)
• 49. تکنیک‌های Single-Cell RNA-Seq
• 50. تحلیل خوشه‌بندی (Clustering) در داده‌های تک‌سلولی
• 51. بیوانفورماتیک در کشف دارو
• 52. شناسایی هدف‌های دارویی
• 53. غربالگری مجازی (Virtual Screening)
• 54. مدل‌سازی مولکولی و طراحی دارو
• 55. فارماکوژنومیکس: پاسخ‌های دارویی مرتبط با ژنتیک
• 56. بیوانفورماتیک در تشخیص بیماری
• 57. نشانگرهای زیستی (Biomarkers)
• 58. تحلیل داده‌های ژنومی برای تشخیص بیماری
• 59. تشخیص زودهنگام بیماری‌ها با استفاده از بیوانفورماتیک
• 60. بیوانفورماتیک در پزشکی شخصی
• 61. تحلیل ژنوم فردی
• 62. پیش‌بینی خطر ابتلا به بیماری‌ها
• 63. درمان‌های شخصی‌سازی‌شده بر اساس اطلاعات ژنومی
• 64. بیوانفورماتیک در کشاورزی
• 65. بهبود ژنتیکی گیاهان و دام‌ها
• 66. شناسایی ژن‌های مرتبط با صفات مطلوب
• 67. تولید محصولات کشاورزی مقاوم به بیماری‌ها
• 68. بیوانفورماتیک در میکروبیوم
• 69. تحلیل میکروبیوم روده و سایر محیط‌ها
• 70. تاثیر میکروبیوم بر سلامت انسان
• 71. مهندسی میکروبیوم
• 72. بیوانفورماتیک در تکامل
• 73. ژنومیک جمعیت
• 74. تحلیل تنوع ژنتیکی
• 75. شناسایی انتخاب طبیعی
• 76. بیوانفورماتیک در ایمونولوژی
• 77. ایمونوانفورماتیک: تحلیل داده‌های سیستم ایمنی
• 78. طراحی واکسن با استفاده از بیوانفورماتیک
• 79. پیش‌بینی اپی‌توپ‌ها
• 80. مقدمه‌ای بر یادگیری ماشین در بیوانفورماتیک
• 81. الگوریتم‌های طبقه‌بندی (Classification)
• 82. الگوریتم‌های خوشه‌بندی (Clustering)
• 83. شبکه‌های عصبی مصنوعی (Artificial Neural Networks)
• 84. یادگیری عمیق (Deep Learning) در بیوانفورماتیک
• 85. کاربرد یادگیری ماشین در پیش‌بینی ساختار پروتئین
• 86. کاربرد یادگیری ماشین در تشخیص بیماری
• 87. کاربرد یادگیری ماشین در کشف دارو
• 88. بیوانفورماتیک و داده‌های بزرگ (Big Data)
• 89. چالش‌های تحلیل داده‌های بزرگ زیستی
• 90. سیستم‌های مدیریت داده‌های بزرگ
• 91. محاسبات ابری (Cloud Computing) در بیوانفورماتیک
• 92. امنیت داده‌ها در بیوانفورماتیک
• 93. ملاحظات اخلاقی در بیوانفورماتیک
• 94. حریم خصوصی داده‌های ژنتیکی
• 95. مالکیت معنوی داده‌های زیستی
• 96. مقدمه‌ای بر زبان برنامه‌نویسی Python برای بیوانفورماتیک
• 97. کار با کتابخانه‌های بیوانفورماتیکی (BioPython)
• 98. اسکریپت‌نویسی برای تحلیل داده‌های زیستی
• 99. بصری‌سازی داده‌های زیستی
• 100. ابزارهای بصری‌سازی داده‌ها