فلش‌کارت‌های آموزشی تحلیل مبتنی بر گراف در کشف مکانیزم‌های علّی خواب و سلامت متابولیک

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره تحلیل مبتنی بر گراف در کشف مکانیزم‌های علّی خواب و سلامت متابولیک

موضوع کلی: روش‌های پیشرفته در استنباط علّی

موضوع میانی: استنباط علّی در تجزیه و تحلیل علل تأثیر خواب بر سلامت (Sleep Impact on Health Cause Analysis)

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه: مفاهیم پایه
• 2. انگیزه و اهمیت موضوع
• 3. مرور ادبیات: خواب و سلامت متابولیک
• 4. مرور ادبیات: گراف‌ها و تحلیل شبکه‌ای
• 5. مرور ادبیات: روابط علی و ساختارهای علّی
• 6. کشف مکانیزم‌های علّی: چالش‌ها
• 7. مقدمه‌ای بر تحلیل مبتنی بر گراف
• 8. انواع گراف‌ها: جهت‌دار و بدون جهت
• 9. انواع گراف‌ها: وزن‌دار و بدون وزن
• 10. ساختارهای گراف: گره‌ها و یال‌ها
• 11. نمایش داده‌های خواب در قالب گراف
• 12. نمایش داده‌های متابولیک در قالب گراف
• 13. مدل‌سازی روابط بین خواب و متابولیسم
• 14. تحلیل مبتنی بر گراف برای شناسایی همبستگی‌ها
• 15. تفاوت همبستگی و علیت
• 16. مقدمه‌ای بر استنباط علی
• 17. مدل‌های ساختاری علی (SEM)
• 18. کاربرد SEM در تحلیل داده‌های زیستی
• 19. مقدمه‌ای بر شبکه‌های بیولوژیکی
• 20. شبکه‌های تنظیم ژنی
• 21. شبکه‌های پروتئین-پروتئین
• 22. شبکه‌های متابولیکی
• 23. شبکه‌های هم‌تظهوری ژنی
• 24. شبکه‌های تعاملات مولکولی
• 25. پایگاه‌های داده شبکه‌های زیستی
• 26. تکنیک‌های تحلیل گراف: مرکزیت
• 27. مرکزیت درجه
• 28. مرکزیت بینابینی
• 29. مرکزیت نزدیکی
• 30. مرکزیت کاریزما
• 31. تکنیک‌های تحلیل گراف: خوشه‌بندی
• 32. خوشه‌بندی سلسله مراتبی
• 33. خوشه‌بندی k-means
• 34. خوشه‌بندی مبتنی بر تراکم
• 35. تشخیص جوامع در گراف‌ها
• 36. تحلیل مسیر در گراف‌ها
• 37. مسیرهای کوتاه‌ترین
• 38. مسیرهای علی
• 39. شناسایی مولفه‌های کلیدی در شبکه‌های خواب
• 40. شناسایی مولفه‌های کلیدی در شبکه‌های متابولیک
• 41. کشف گره‌های مهم در ارتباط با سلامت متابولیک
• 42. کشف گره‌های مهم در ارتباط با اختلالات خواب
• 43. تحلیل پویایی شبکه‌ها
• 44. تغییرات گراف در طول زمان
• 45. تکامل شبکه‌های زیستی
• 46. تحلیل گراف در داده‌های پان-اُمیکس
• 47. ادغام داده‌های ژنومیک، پروتئومیک و متابولومیک
• 48. یکپارچه‌سازی داده‌های خواب و متابولیک
• 49. ساخت گراف‌های ترکیبی
• 50. تحلیل گراف در مطالعات همبستگی ژنوم-خواب
• 51. تحلیل گراف در مطالعات همبستگی ژنوم-متابولیک
• 52. تحلیل گراف در مطالعات همبستگی خواب-متابولیک
• 53. استنتاج علی از شبکه‌های هم‌تظهوری
• 54. استنتاج علی از شبکه‌های تعامل پروتئین-پروتئین
• 55. استنتاج علی از شبکه‌های تنظیم ژنی
• 56. استنتاج علی از شبکه‌های متابولیکی
• 57. مدل‌سازی ساختاری علی در شبکه‌های زیستی
• 58. استفاده از آزمون‌های علی در تحلیل گراف
• 59. روش‌های آماری برای آزمون علیت
• 60. آزمون گریجر-کازالت
• 61. آزمون شپیر-ویلک
• 62. روش‌های مبتنی بر مداخله
• 63. شبیه‌سازی در تحلیل مبتنی بر گراف
• 64. شبیه‌سازی اثرات تغییر در گره‌ها
• 65. شبیه‌سازی اثرات حذف یال‌ها
• 66. پیش‌بینی پیامدهای تغییرات
• 67. ارزیابی حساسیت مدل‌های گراف
• 68. اعتبار سنجی مدل‌های گراف
• 69. اعتبار سنجی متقابل
• 70. اعتبارسنجی با داده‌های مستقل
• 71. تفسیر نتایج تحلیل گراف
• 72. محدودیت‌های تحلیل مبتنی بر گراف
• 73. نیاز به داده‌های با کیفیت
• 74. پیچیدگی محاسباتی
• 75. چالش‌های تفسیر پذیری
• 76. ارتباط با رویکردهای دیگر در کشف مکانیزم‌ها
• 77. مقایسه با روش‌های آماری کلاسیک
• 78. مقایسه با یادگیری ماشین
• 79. کاربردها در تحقیقات پایه
• 80. کاربردها در تحقیقات بالینی
• 81. شناسایی اهداف دارویی جدید
• 82. پیش‌بینی ریسک بیماری
• 83. شخصی‌سازی درمان
• 84. مطالعات روی مدل‌های حیوانی
• 85. مطالعات روی داده‌های انسانی
• 86. مطالعات طولی
• 87. مطالعات مقطعی
• 88. مطالعات مداخله‌ای
• 89. جمع‌آوری داده‌های خواب دقیق
• 90. جمع‌آوری داده‌های متابولیک دقیق
• 91. پروتکل‌های استاندارد در جمع‌آوری داده
• 92. تحلیل و پیش‌پردازش داده‌ها
• 93. فیلتر کردن نویز
• 94. نرمال‌سازی داده‌ها
• 95. انتخاب ویژگی
• 96. معیارهای ارزیابی کیفیت گراف
• 97. شاخص‌های آماری در تحلیل گراف
• 98. مقیاس‌پذیری الگوریتم‌ها
• 99. پیاده‌سازی نرم‌افزاری
• 100. ابزارهای موجود برای تحلیل گراف