فلش‌کارت‌های آموزشی مقدمه‌ای کاربردی بر بیوانفورماتیک و تحلیل داده‌های ژنومیک

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره مقدمه‌ای کاربردی بر بیوانفورماتیک و تحلیل داده‌های ژنومیک

موضوع کلی: علوم زیستی و فناوری‌های مرتبط

موضوع میانی: زیست‌فناوری و تحلیل داده‌های زیستی

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر بیوانفورماتیک
• 2. داده‌های زیستی و انواع آن‌ها
• 3. ساختار و ذخیره‌سازی داده‌های زیستی
• 4. اصول پایگاه‌های داده زیستی
• 5. مروری بر ساختار DNA و RNA
• 6. اصول توالی‌یابی DNA
• 7. روش‌های مختلف توالی‌یابی نسل جدید
• 8. پردازش اولیه داده‌های توالی‌یابی
• 9. کنترل کیفیت داده‌های توالی‌یابی
• 10. هم‌ترازی توالی‌ها: مفاهیم پایه
• 11. الگوریتم‌های هم‌ترازی سراسری (Global Alignment)
• 12. الگوریتم‌های هم‌ترازی محلی (Local Alignment)
• 13. هم‌ترازی چندگانه توالی‌ها (Multiple Sequence Alignment)
• 14. کاربرد هم‌ترازی در شناسایی ژن
• 15. کاربرد هم‌ترازی در شناسایی پروتئین
• 16. جستجو در پایگاه‌های داده توالی
• 17. پایگاه داده NCBI: GenBank
• 18. پایگاه داده EBI: EMBL-EBI
• 19. ابزارهای جستجوی توالی: BLAST
• 20. انواع BLAST و کاربردهای آن‌ها
• 21. جستجوی توالی پروتئین: BLASTp
• 22. جستجوی توالی نوکلئوتیدی: BLASTn
• 23. جستجوی توالی در پایگاه‌های مختلف
• 24. تحلیل داده‌های بیان ژن
• 25. ریزآرایه‌ها (Microarrays)
• 26. توالی‌یابی RNA (RNA-Seq)
• 27. پردازش داده‌های RNA-Seq
• 28. شناسایی و تفکیک ژن‌ها (Gene Identification)
• 29. پیش‌بینی ژن (Gene Prediction)
• 30. شناسایی نواحی کدکننده پروتئین
• 31. شناسایی نواحی غیرکدکننده
• 32. تحلیل داده‌های بیان ژن با استفاده از RNA-Seq
• 33. مدل‌سازی آماری برای بیان ژن
• 34. شناسایی ژن‌های تفاضلی (Differential Gene Expression)
• 35. طبقه‌بندی ژن‌ها بر اساس بیان
• 36. تجسم داده‌های بیان ژن
• 37. شبکه‌های تنظیم ژن
• 38. مدل‌سازی شبکه‌های تنظیم ژن
• 39. تحلیل مسیرهای متابولیکی
• 40. شناسایی مسیرهای مرتبط با بیماری
• 41. کاربرد بیوانفورماتیک در پزشکی
• 42. تشخیص بیماری‌های ژنتیکی
• 43. طراحی دارو با رویکرد بیوانفورماتیک
• 44. شبیه‌سازی مولکولی پروتئین‌ها
• 45. پیش‌بینی ساختار سه‌بعدی پروتئین‌ها
• 46. روش‌های پیش‌بینی ساختار پروتئین
• 47. کیفیت‌سنجی ساختارهای پیش‌بینی‌شده
• 48. کاربرد پروتئین‌های پیش‌بینی‌شده
• 49. تحلیل داده‌های ژنومیک مقایسه‌ای
• 50. شناسایی همولوگ‌ها و ارتوگ‌ها
• 51. آنالیز فیلوژنتیک
• 52. ساخت درخت فیلوژنتیک
• 53. روش‌های ساخت درخت فیلوژنتیک
• 54. ارزیابی کیفیت درخت فیلوژنتیک
• 55. کاربرد درختان فیلوژنتیک
• 56. بیوانفورماتیک ساختاری
• 57. پایگاه داده‌های ساختار پروتئین: PDB
• 58. ابزارهای تحلیل ساختار پروتئین
• 59. توصیف ساختار پروتئین
• 60. مقایسه ساختارهای پروتئین
• 61. تطابق ساختارها
• 62. کاربرد بیوانفورماتیک در کشاورزی
• 63. بهینه‌سازی ژنتیکی محصولات کشاورزی
• 64. شناسایی ژن‌های مرتبط با مقاومت
• 65. بیوانفورماتیک در میکروبیولوژی
• 66. تحلیل جامعه میکروبی (Metagenomics)
• 67. شناسایی و طبقه‌بندی میکروارگانیسم‌ها
• 68. پردازش داده‌های Metagenomics
• 69. تحلیل داده‌های Metatranscriptomics
• 70. کاربرد بیوانفورماتیک در سلامت عمومی
• 71. ردیابی و تحلیل همه‌گیری‌ها
• 72. تحلیل داده‌های اپیدمیولوژیک
• 73. امنیت داده‌های زیستی
• 74. اصول حفاظت از داده‌های زیستی
• 75. اخلاق در بیوانفورماتیک
• 76. مسئولیت‌های اخلاقی پژوهشگران
• 77. مقدمه‌ای بر هوش مصنوعی در بیوانفورماتیک
• 78. یادگیری ماشین در تحلیل داده‌های زیستی
• 79. شبکه‌های عصبی در بیوانفورماتیک
• 80. کاربرد شبکه‌های عصبی در پیش‌بینی
• 81. یادگیری عمیق در بیوانفورماتیک
• 82. تحلیل داده‌های حجیم زیستی (Big Data)
• 83. چالش‌های تحلیل داده‌های حجیم
• 84. ابزارهای پردازش داده‌های حجیم
• 85. مقدمه‌ای بر برنامه‌نویسی برای بیوانفورماتیک
• 86. زبان برنامه‌نویسی پایتون در بیوانفورماتیک
• 87. کتابخانه‌های پایتون برای بیوانفورماتیک
• 88. کاربرد R در بیوانفورماتیک
• 89. ابزارهای خط فرمان (Command Line Tools)
• 90. سیستم‌های مدیریت داده زیستی
• 91. مقدمه‌ای بر داده‌های اپی‌ژنتیک
• 92. تحلیل داده‌های متیلاسیون DNA
• 93. تحلیل داده‌های تغییرات هیستون
• 94. کاربرد بیوانفورماتیک در پزشکی شخصی
• 95. طراحی درمان‌های شخصی‌سازی‌شده
• 96. تحلیل داده‌های تک‌سلولی (Single-cell data)
• 97. پردازش و تحلیل داده‌های تک‌سلولی
• 98. شناسایی انواع سلول‌ها
• 99. تحلیل مسیرهای سلولی در سطح تک‌سلولی
• 100. کاربرد بیوانفورماتیک در داروسازی