, ,

کتاب مقدمه‌ای بر محاسبات در مدل‌سازی زیستی

تومان249,950

انتخاب پلن

torobpay
هر قسط با ترب‌پی: تومان62,488
۴ قسط ماهانه. بدون سود، چک و ضامن.

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

💡 این محصول یک نسخهٔ کامل و جامع است

تمامی محتوای آموزشی این کتاب در قالب یک بسته‌ی کامل و یکپارچه ارائه می‌شود و شامل تمام نسخه‌ها و فایل‌های موردنیاز برای یادگیری است.

🎁 محتویات کامل بسته دانلودی

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی .


ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود و نسخهٔ چاپی ندارد.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های کتاب همانجا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

📚 کتاب آموزشی جامع

📚 اطلاعات کتاب

عنوان کتاب: کتاب مقدمه‌ای بر محاسبات در مدل‌سازی زیستی

موضوع کلی: برنامه نویسی

موضوع میانی: محاسبات سطح بالا (High-Performance Computing)

📋 سرفصل‌های کتاب (100 موضوع)

  • 1. مقدمه‌ای بر مدل‌سازی محاسباتی در علوم زیستی
  • 2. چرا به محاسبات سطح بالا (HPC) در زیست‌شناسی نیاز داریم؟
  • 3. آشنایی با محیط خط فرمان (Command Line) و شل (Shell)
  • 4. دستورات پایه‌ای لینوکس: ناوبری و مدیریت فایل‌ها
  • 5. کار با متن در خط فرمان: grep, sed, awk
  • 6. مبانی برنامه‌نویسی: متغیرها، انواع داده‌ها و عملگرها
  • 7. ساختارهای کنترلی: دستورات شرطی و حلقه‌ها
  • 8. توابع و ماژول‌ها: ساختاردهی به کد
  • 9. ساختارهای داده پایه: لیست‌ها، تاپل‌ها و دیکشنری‌ها
  • 10. آشنایی با پایتون به عنوان زبان اصلی دوره
  • 11. نصب و مدیریت پکیج‌ها در پایتون (Pip و Conda)
  • 12. مقدمه‌ای بر کنترل نسخه با Git
  • 13. مفاهیم اساسی Git: commit, push, pull, branch
  • 14. زبان‌های کامپایلری (C++/Fortran) در مقابل زبان‌های مفسری (Python)
  • 15. نوشتن و اجرای اولین اسکریپت محاسباتی
  • 16. خواندن و نوشتن فایل‌ها در برنامه‌نویسی
  • 17. فرمت‌های داده رایج در بیوانفورماتیک (FASTA, PDB, VCF)
  • 18. مقدمه‌ای بر الگوریتم‌ها و پیچیدگی محاسباتی
  • 19. اصول دیباگ کردن و رفع خطا در کد
  • 20. مدیریت محیط‌های مجازی (Virtual Environments)
  • 21. محاسبات عددی با کتابخانه NumPy
  • 22. آرایه‌های چندبعدی و عملیات برداری در NumPy
  • 23. تحلیل داده‌های جدولی با Pandas
  • 24. پاکسازی و آماده‌سازی داده‌های زیستی با Pandas
  • 25. مصورسازی داده‌ها با Matplotlib و Seaborn
  • 26. کتابخانه SciPy و کاربردهای آن در علوم
  • 27. مبانی جبر خطی برای مدل‌سازی زیستی
  • 28. حل دستگاه معادلات دیفرانسیل معمولی (ODE)
  • 29. بهینه‌سازی عددی و یافتن حداقل توابع
  • 30. درون‌یابی و برازش منحنی (Interpolation and Curve Fitting)
  • 31. انتگرال‌گیری عددی
  • 32. روش‌های مونت کارلو و شبیه‌سازی تصادفی
  • 33. مقدمه‌ای بر پردازش سیگنال و تصویر در بیولوژی
  • 34. برنامه‌نویسی شیءگرا (Object-Oriented Programming) و کاربرد آن
  • 35. پروفایلینگ (Profiling) کد پایتون برای شناسایی گلوگاه‌ها
  • 36. بهینه‌سازی کدهای پایتون با Cython
  • 37. واسط پایتون با کدهای C/C++ (Python C API/ctypes)
  • 38. مقدمه‌ای بر C++ برای محاسبات علمی
  • 39. ساختارهای داده پیشرفته در C++ (STL)
  • 40. کامپایل و لینک کردن برنامه‌های C++ با g++
  • 41. معماری کامپیوترهای مدرن: CPU، حافظه و کش
  • 42. سلسله مراتب حافظه و تأثیر آن بر عملکرد
  • 43. مفهوم محاسبات موازی و انواع آن
  • 44. قانون امدال (Amdahl's Law) و محدودیت‌های موازی‌سازی
  • 45. معماری کلاسترهای HPC: نودهای محاسباتی، شبکه و ذخیره‌سازی
  • 46. آشنایی با سیستم‌های حافظه اشتراکی (Shared Memory)
  • 47. آشنایی با سیستم‌های حافظه توزیع‌شده (Distributed Memory)
  • 48. شبکه‌های اتصال داخلی (Interconnects) در کلاسترها (InfiniBand)
  • 49. سیستم‌های فایل موازی (Parallel File Systems) مانند Lustre
  • 50. نرم‌افزارهای مدیریت منابع و زمان‌بندها (Job Schedulers)
  • 51. آشنایی با SLURM: ارسال و مدیریت جاب‌ها
  • 52. نوشتن اسکریپت‌های ارسال جاب (Job Submission Scripts)
  • 53. نظارت (Monitoring) بر وضعیت جاب‌ها و منابع
  • 54. کامپایلرها و فلگ‌های بهینه‌سازی (Optimization Flags)
  • 55. مدیریت ماژول‌های نرم‌افزاری (Environment Modules)
  • 56. چالش‌های ورودی/خروجی (I/O) در مقیاس بزرگ
  • 57. اصول بهینه‌سازی عملکرد (Performance Tuning)
  • 58. اندازه‌گیری و تحلیل عملکرد: Benchmarking
  • 59. مفهوم مقیاس‌پذیری (Scalability): Strong vs. Weak Scaling
  • 60. مقدمه‌ای بر محاسبات روی پردازنده‌های گرافیکی (GPU Computing)
  • 61. مدل برنامه‌نویسی حافظه اشتراکی: OpenMP
  • 62. دستورات (Directives) پایه‌ای در OpenMP: parallel, for
  • 63. همگام‌سازی (Synchronization) در OpenMP
  • 64. متغیرهای خصوصی و اشتراکی در OpenMP
  • 65. مدل برنامه‌نویسی حافظه توزیع‌شده: MPI (Message Passing Interface)
  • 66. راه‌اندازی و اجرای یک برنامه MPI
  • 67. ارتباطات نقطه به نقطه (Point-to-Point) در MPI
  • 68. ارتباطات جمعی (Collective Communications) در MPI
  • 69. انواع داده‌های سفارشی در MPI
  • 70. توپولوژی‌های مجازی در MPI
  • 71. ورودی/خروجی موازی با MPI-IO
  • 72. دیباگ کردن برنامه‌های موازی (MPI/OpenMP)
  • 73. مدل ترکیبی MPI + OpenMP
  • 74. مقدمه‌ای بر معماری GPU
  • 75. مدل برنامه‌نویسی CUDA: کرنل‌ها، نخ‌ها و بلاک‌ها
  • 76. مدیریت حافظه در CUDA: حافظه Global, Shared, Constant
  • 77. اولین برنامه CUDA: جمع برداری
  • 78. بهینه‌سازی کدهای CUDA
  • 79. کتابخانه‌های علمی مبتنی بر GPU (cuBLAS, cuFFT)
  • 80. آشنایی با OpenACC: رویکردی ساده‌تر برای برنامه‌نویسی GPU
  • 81. کاربرد HPC در هم‌ترازی توالی (Sequence Alignment)
  • 82. موازی‌سازی الگوریتم BLAST
  • 83. مونتاژ ژنوم در مقیاس بزرگ (Genome Assembly)
  • 84. تحلیل داده‌های توالی‌یابی نسل جدید (NGS)
  • 85. مقدمه‌ای بر شبیه‌سازی دینامیک مولکولی (Molecular Dynamics)
  • 86. اصول الگوریتم‌های MD و میدان‌های نیرو (Force Fields)
  • 87. اجرای شبیه‌سازی MD با نرم‌افزارهای GROMACS/NAMD روی کلاستر
  • 88. تحلیل نتایج شبیه‌سازی‌های MD
  • 89. مدل‌سازی داکینگ مولکولی (Molecular Docking) برای کشف دارو
  • 90. غربالگری مجازی با توان محاسباتی بالا (High-Throughput Virtual Screening)
  • 91. ساخت درخت‌های تبارزایی (Phylogenetics) با داده‌های عظیم
  • 92. مدل‌سازی شبکه‌های زیستی و دینامیک سیستم‌ها
  • 93. پردازش و تحلیل تصاویر میکروسکوپی در مقیاس بزرگ (Cryo-EM)
  • 94. یادگیری ماشین و یادگیری عمیق در زیست‌شناسی محاسباتی
  • 95. آموزش مدل‌های یادگیری عمیق روی چندین GPU
  • 96. مدیریت داده‌های علمی و بهترین شیوه‌ها
  • 97. مصورسازی علمی داده‌های حجیم (Scientific Visualization) با ParaView
  • 98. تکرارپذیری محاسباتی: کانتینرها (Docker/Singularity)
  • 99. محاسبات سطح بالا در محیط‌های ابری (Cloud HPC)
  • 100. روندهای آینده در محاسبات زیستی: Exascale و هوش مصنوعی

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

💡 این محصول یک نسخهٔ کامل و جامع است

تمامی محتوای آموزشی این کتاب در قالب یک بسته‌ی کامل و یکپارچه ارائه می‌شود و شامل تمام نسخه‌ها و فایل‌های موردنیاز برای یادگیری است.

🎁 محتویات کامل بسته دانلودی

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی .


ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود و نسخهٔ چاپی ندارد.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های کتاب همانجا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

دیدگاهها

هیچ دیدگاهی برای این محصول نوشته نشده است.

اولین نفری باشید که دیدگاهی را ارسال می کنید برای “کتاب مقدمه‌ای بر محاسبات در مدل‌سازی زیستی”

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *

پیمایش به بالا