کتاب تحلیل عملی داده‌های RNA-seq: از پیش‌پردازش تا تفسیر بیولوژیکی
, ,

کتاب تحلیل عملی داده‌های RNA-seq: از پیش‌پردازش تا تفسیر بیولوژیکی

تومان249,950

انتخاب پلن

torobpay
هر قسط با ترب‌پی: تومان62,488
۴ قسط ماهانه. بدون سود، چک و ضامن.
شناسه محصول: SuperCourse-0000020627 دسته: , , برچسب: , , , , , , , , , , , , ,

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

💡 این محصول یک نسخهٔ کامل و جامع است

تمامی محتوای آموزشی این کتاب در قالب یک بسته‌ی کامل و یکپارچه ارائه می‌شود و شامل تمام نسخه‌ها و فایل‌های موردنیاز برای یادگیری است.

🎁 محتویات کامل بسته دانلودی

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی .

ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود و نسخهٔ چاپی ندارد.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های کتاب همانجا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

📚 کتاب آموزشی جامع

📚 اطلاعات کتاب

عنوان کتاب: کتاب تحلیل عملی داده‌های RNA-seq: از پیش‌پردازش تا تفسیر بیولوژیکی

موضوع کلی: زیست‌شناسی مولکولی و ژنتیک

موضوع میانی: تحلیل داده‌های ژنومیک

📋 سرفصل‌های کتاب (100 موضوع)

  • 1. آشنایی با RNA-seq: چیستی، چرایی و زمان استفاده
  • 2. مرور زیست‌شناسی مولکولی: ژن‌ها، رونویسی‌ها، تنظیم
  • 3. مفهوم بیان ژن
  • 4. مروری بر توالی‌یابی نسل جدید (NGS)
  • 5. گردش کار RNA-seq: مروری گام به گام
  • 6. مزایا و چالش‌های فناوری RNA-seq
  • 7. کاربردهای کلیدی RNA-seq در تحقیقات
  • 8. مقایسه RNA-seq با سایر روش‌های پروفایلینگ بیان
  • 9. انواع داده‌های بنیادی و فرمت‌های فایل
  • 10. اصول طراحی آزمایش قوی برای RNA-seq
  • 11. تکرارهای بیولوژیکی: اهمیت و تعداد
  • 12. شناسایی و مدیریت عوامل مخدوش‌کننده (اثرات بچ)
  • 13. تحلیل توان آماری برای مطالعات RNA-seq
  • 14. ملاحظات اخلاقی و برنامه‌ریزی مدیریت داده
  • 15. جداسازی RNA: روش‌ها و ارزیابی خلوص
  • 16. ارزیابی یکپارچگی RNA: امتیاز RIN
  • 17. غنی‌سازی mRNA در مقابل حذف RNA ریبوزومی
  • 18. مروری بر آماده‌سازی کتابخانه: از RNA تا آداپتورهای توالی‌یابی
  • 19. آماده‌سازی کتابخانه رشته‌خاص (Strand-Specific): مزایا
  • 20. مالتی‌پلکسینگ کتابخانه‌های RNA-seq با بارکدها
  • 21. کنترل کیفیت کتابخانه: غلظت، اندازه قطعه و qPCR
  • 22. اصول توالی‌یابی سنتز-بر-اساس-الیلومینا (Illumina Sequencing-by-Synthesis)
  • 23. استراتژی‌های توالی‌یابی تک-انتها (Single-End) در مقابل دو-انتها (Paired-End)
  • 24. درک داده‌های توالی‌یابی خام: فرمت FASTQ
  • 25. ملاحظات عمق توالی‌یابی و طول خوانش
  • 26. آشنایی با خط فرمان لینوکس/یونیکس
  • 27. فرمان‌های ضروری Shell برای دستکاری داده‌ها
  • 28. پیمایش سیستم‌های فایل و مجوزها
  • 29. مدیریت نرم‌افزار با Conda و Mamba
  • 30. اسکریپت‌نویسی Shell مقدماتی برای خودکارسازی
  • 31. آشنایی با محاسبات با کارایی بالا (HPC) و منابع ابری
  • 32. ارزیابی اولیه فایل‌های FASTQ
  • 33. FastQC: تولید گزارش‌های کیفیت
  • 34. تفسیر خروجی FastQC: مسائل رایج کیفیت
  • 35. حذف آداپتور و آلاینده‌ها با ابزارهایی مانند Trimmomatic/fastp
  • 36. فیلتر کردن خوانش‌ها و بازهای با کیفیت پایین
  • 37. MultiQC: تجمیع و خلاصه‌سازی گزارش‌های QC
  • 38. بررسی‌های کیفیت پیشرفته: آلودگی و تکرار
  • 39. نقش ژنوم‌های مرجع در تحلیل RNA-seq
  • 40. منابع اصلی ژنوم مرجع (Ensembl, NCBI, UCSC)
  • 41. فایل‌های حاشیه‌نویسی ژن: توضیح فرمت‌های GTF/GFF
  • 42. ساخت ایندکس ژنوم مرجع برای هم‌ترازی
  • 43. کار با ژنوم‌های ارگانیسم‌های غیرمدل
  • 44. اصول هم‌ترازی Spliced برای RNA-seq
  • 45. هم‌ترازی‌کننده STAR: راه‌اندازی و استفاده اولیه
  • 46. HISAT2: یک هم‌ترازی‌کننده Spliced جایگزین
  • 47. فرمت‌های فایل SAM/BAM: ساختار و محتوا
  • 48. تفسیر آمارهای هم‌ترازی (فایل‌های Log)
  • 49. دستکاری فایل‌های BAM با Samtools و Sambamba
  • 50. تجسم خوانش‌های هم‌تراز شده با IGV
  • 51. مدیریت خوانش‌های چند-نگاشته شده (Multi-Mapped) و خوانش‌های تکراری
  • 52. بهترین روش‌ها برای هم‌ترازی خوانش‌ها
  • 53. مروری بر روش‌های کمی‌سازی بیان ژن
  • 54. شمارش ویژگی‌ها: استفاده از featureCounts
  • 55. شمارش ویژگی‌ها: استفاده از HTSeq-count
  • 56. شبه-هم‌ترازی برای کمی‌سازی: Salmon
  • 57. شبه-هم‌ترازی برای کمی‌سازی: Kallisto
  • 58. مقایسه روش‌های مبتنی بر شمارش در مقابل شبه-هم‌ترازی
  • 59. شمارش‌های خام در مقابل مقادیر بیان نرمال‌سازی شده
  • 60. طرح‌های مختلف نرمال‌سازی (TPM, FPKM, RPKM)
  • 61. آماده‌سازی ماتریس‌های شمارش برای تحلیل‌های پایین‌دست
  • 62. بیان افتراقی ژن (DGE) چیست؟
  • 63. مفاهیم آماری: آزمون فرضیه، P-values
  • 64. مشکل آزمون‌های چندگانه و تنظیم P-value
  • 65. تفسیر نرخ کشف کاذب (FDR) و q-value
  • 66. مدل‌های آماری برای داده‌های شمارشی RNA-seq
  • 67. آشنایی با بسته R DESeq2
  • 68. ایجاد یک شیء DESeqDataSet: داده‌های ورودی و طراحی
  • 69. اجرای خط لوله تحلیل DESeq2
  • 70. استخراج و تفسیر نتایج DESeq2 (Log2FC, P-adjust)
  • 71. فشرده‌سازی تغییرات Log2 Fold برای تخمین بهتر
  • 72. تجسم نتایج DESeq2: نمودار MA و نمودار Volcano
  • 73. مدیریت طرح‌های آزمایش پیچیده با DESeq2
  • 74. گنجاندن و تصحیح اثرات بچ در مدل DESeq2
  • 75. آشنایی با بسته R edgeR
  • 76. آماده‌سازی داده و اجرای تحلیل edgeR
  • 77. تفسیر نتایج edgeR
  • 78. آشنایی با Limma-Voom برای داده‌های RNA-seq
  • 79. اجرای تحلیل Limma-Voom
  • 80. مرور مقایسه‌ای DESeq2، edgeR و Limma-Voom
  • 81. اصول تحلیل غنی‌سازی عملکردی
  • 82. غنی‌سازی Gene Ontology (GO): مفاهیم و دسته‌بندی‌ها
  • 83. تحلیل مسیرهای KEGG: شناسایی مسیرهای غنی‌شده
  • 84. ابزارهایی برای تحلیل غنی‌سازی: clusterProfiler در R
  • 85. تحلیل غنی‌سازی مجموعه ژنی (GSEA): یک رویکرد تکمیلی
  • 86. تفسیر و اعتبارسنجی نتایج غنی‌سازی
  • 87. تجسم پیشرفته نتایج غنی‌سازی (مثلاً نمودارهای نقطه‌ای، نمودارهای شبکه)
  • 88. ساخت و تجسم شبکه‌های هم‌بیانی ژن
  • 89. یکپارچه‌سازی داده‌های RNA-seq با پایگاه‌های داده عمومی
  • 90. تولید نمودارهای با کیفیت انتشاراتی
  • 91. تحلیل Splicing افتراقی: DEXSeq و rMATS
  • 92. مونتاژ De Novo ترنسکریپت (مثلاً با Trinity)
  • 93. تحلیل RNAهای بلند غیرکدکننده (lncRNAs)
  • 94. RNA-seq سری زمانی: روش‌هایی برای بیان پویا
  • 95. مقدمه‌ای بر تحلیل RNA-seq تک سلولی (scRNA-seq)
  • 96. ترنسکریپتومیکس فضایی: مفاهیم و فناوری‌های نوظهور
  • 97. تحلیل بیان آلل-خاص (ASE)
  • 98. شناسایی هم‌جوشی ژنی از داده‌های RNA-seq
  • 99. عیب‌یابی مسائل رایج تحلیل RNA-seq
  • 100. پژوهش‌های قابل تکرار و بهترین روش‌ها در بیوانفورماتیک

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

💡 این محصول یک نسخهٔ کامل و جامع است

تمامی محتوای آموزشی این کتاب در قالب یک بسته‌ی کامل و یکپارچه ارائه می‌شود و شامل تمام نسخه‌ها و فایل‌های موردنیاز برای یادگیری است.

🎁 محتویات کامل بسته دانلودی

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی .

ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود و نسخهٔ چاپی ندارد.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های کتاب همانجا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

دیدگاهها

هیچ دیدگاهی برای این محصول نوشته نشده است.

اولین نفری باشید که دیدگاهی را ارسال می کنید برای “کتاب تحلیل عملی داده‌های RNA-seq: از پیش‌پردازش تا تفسیر بیولوژیکی”

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *

محصولات مشابه

پیمایش به بالا